来源:生物谷 作者:蒲公英
时间:2020-10-12
截至2020年10月,SARS-CoV-2导致了持续的大流行,全球报告的病例超过3500万,死亡人数超过100万。与SARS-CoV和A型流感病毒相比,在免疫反应方面将COVID-19与SARS区别开来的一个突出特征是SARS-CoV-2对I型干扰素(IFN)的诱导作用较差。值得注意的是,受损的IFN应答与COVID-19疾病有关。但是,在SARS-CoV-2感染中低效IFN反应的分子机制尚不清楚。
东京大学医学科学研究所(IMSUT)的一个研究小组旨在鉴定决定SARS-CoV-2感染后免疫激活的病毒因子,并发现由SARS-CoV-2编码的基因ORF3b是有效的IFN拮抗剂。
首席科学家,传染病控制部系统病毒学副教授Kei Sato说:“ COVID-19患者的IFN反应不良可能是由于这种病毒产物ORF3b的作用所致。”
尽管SARS-CoV感染会引起急性和严重的肺炎,但SARS-CoV-2感染可能是无症状的或导致类似流感的症状,例如发烧,咳嗽和疲劳。而且,与SARS-CoV和A型流感病毒感染相比,SARS-CoV-2感染的标志COVID-19是对I型干扰素(IFN)的不良诱导。值得注意的是,受损的IFN应答与COVID-19的严重程度有关。但是,在SARS-CoV-2感染中低效IFN反应的分子机制尚不清楚。
通过比较SARS-CoV-2编码基因和SARS-CoV的基因序列,研究小组发现SARS-CoV-2 ORF3b的基因长度明显短于SARS-CoV ORF3b的基因长度。
因为SARS-CoV的ORF3b被称为是抗IFN的病毒拮抗剂,所以他们假设SARS-CoV-2和SARS-CoV之间ORF3b基因长度的差异可能会改变其抗IFN活性,并可能进一步解释这一差异。这两种病毒感染的症状。
出乎意料的是,SARS-CoV-2 ORF3b是一种比SARS-CoV ORF3b更有效的IFN拮抗剂。系统发育分析和功能分析表明,蝙蝠和穿山甲的SARS-CoV-2相关病毒还编码具有较强抗IFN活性的较短的ORF3b基因产物。
具有增强的抗IFN活性的天然SARS-CoV-2
ORF3b变体的表征
此外,作者对大约17,000个SARS-CoV-2序列的分析确定了一个自然变异,其中重构了更长的ORF3b阅读框。该变体比亲本SARS-CoV-2株的ORF3b更有效地抑制IFN。
因此,继续监测病毒序列以查看在当前的大流行期间是否出现新的ORF3b突变将很重要。
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